Complete genome analysis of type strain of a novel bacterial family Temperatibacteraceae fam. nov., isolated from surface seawater

生物 基因组 α蛋白细菌 细菌 遗传学 拉伤 基因 细菌圆形染色体 γ蛋白杆菌 细菌基因组大小 海洋噬菌体 全基因组测序 微生物学 16S核糖体RNA 解剖
作者
Jin‐Cheng Rong,Linlin Cui,Xiaochen Yang,Maoli Yi,Qi Zhao
出处
期刊:Marine Genomics [Elsevier BV]
卷期号:72: 101073-101073
标识
DOI:10.1016/j.margen.2023.101073
摘要

Novel bacterial resources are valuable for studying bacterial taxonomy, bacterial evolution, and genome mining of novel antibiotics, antitumor agents, and immune modulators. In this study, we de novo sequenced the type strain of a novel bacterial family, Temperatibacteraceae fam. Nov., belonging to class Alphaproteobacteria of phylum Pseudomonadota. The type strain, Temperatibacter marinus NBRC 110045T, is mesophilic and was isolated from surface seawater around Muroto city of Japan at a depth of 0.5 m. Here, the sequenced complete genome of strain NBRC 110045T is composed of a circular chromosome of 3,184,799 bp with a mean G + C content of 43.71%. Genome analysis was applied to reveal the genetic basis of its cellular activities. Cellular regulation and signaling was analyzed to infer the regulatory mechanism of its limited growth temperature range. Genomic features of the novel family Temperatibacteraceae may expand our knowledge on environmental adaptation, genetic evolution and natural product discovery of marine bacteria.

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