Screening and Interaction Analysis of Shark-Derived Nanobodies against Crayfish Major Allergen Pro c 2

小龙虾 过敏原 动物 渔业 生物 化学 计算生物学 过敏 免疫学
作者
Yang Yang,Xinrong He,Si‐Yang He,Jin-Jin Lin,Fa-Jie Li,Jinli Chen,Shi‐Hong Gu,Tengchuan Jin,Gui-Xia Chen,Guang‐Ming Liu
出处
期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01559
摘要

Pro c 2 (arginine kinase) is a major allergen in crayfish (Procambarus clarkii). Shark-derived variable domains of new antigen receptors (VNARs) have advantages in developing allergen detection and immunotherapy. This study constructed a VNAR domain library from Chiloscyllium plagiosum immunized with Pro c 2. Three VNARs (VNAR-11, VNAR-20, and VNAR-29) against Pro c 2 obtained by screening the library were expressed in the HEK293F cells, fusing with the immunoglobulin (Ig) G1 Fc fragment (VNAR-Fc-11, VNAR-Fc-29, and VNAR-Fc-20). The VNAR-Fc fusions bound to Pro c 2 with an affinity KD ranging from 0.2131 ∼ 465.3 μM, with the ability to inhibit patients' IgE binding to Pro c 2. VNAR-20 and VNAR-29 displayed more stable binding with Pro c 2 during molecular dynamics simulation. The binding sites of the VNARs are distributed in the conserved IgE epitopes of arginine kinase. These achievements indicate the application potential of VNARs in allergen detection and allergy therapeutics.
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