Dna Methylation Episignatures are Sensitive and Specific Biomarkers for Detection of Patients with Kat6A / Kat6B Variants

生物 DNA甲基化 遗传学 表观遗传学 计算生物学 基因 生物信息学 基因表达
作者
Niels Vos,Jack Reilly,Mariet W. Elting,Philippe M. Campeau,David Coman,Zornitza Stark,Tiong Yang Tan,David J. Amor,Simran Kaur,Miya StJohn,Angela Morgan,Benjamin Kamien,Chirag Patel,Matthew L. Tedder,Giuseppe Merla,Paolo Prontera,Marco Castori,Kai Muru,Felicity Collins,John Christodoulou
出处
期刊:Epigenomics [Future Medicine]
卷期号:15 (6): 351-367 被引量:10
标识
DOI:10.2217/epi-2023-0079
摘要

Accurate diagnosis for patients living with neurodevelopmental disorders is often met with numerous challenges, related to the ambiguity of findings and lack of specificity in genetic variants leading to pathology. Genome-wide DNA methylation analysis has been used to develop highly sensitive and specific 'episignatures' as biomarkers capable of differentiating and classifying complex neurodevelopmental disorders. In this study we describe distinct episignatures for KAT6A syndrome, caused by pathogenic variants in the lysine acetyltransferase A gene (KAT6A), and for the two neurodevelopmental disorders associated with lysine acetyl transferase B (KAT6B). We demonstrate the ability of our models to differentiate between highly overlapping episignatures, increasing the ability to effectively identify and diagnose these conditions.
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