Clostridium fessum sp. nov., isolated from human faeces

生物 16S核糖体RNA 系统发育树 拉伤 克莱德 梭菌目 梭菌 核糖体RNA 系统发育学 微生物学 细菌 基因 植物 遗传学 解剖
作者
Boram Seo,Kyungchan Jeon,Inwoo Baek,Yung Mi Lee,Kiwoon Baek,GwangPyo Ko
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:71 (1) 被引量:12
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.004579
摘要

An obligately anaerobic, Gram-stain-positive and spore-forming strain, SNUG30386 T was isolated from a faecal sample of a healthy Korean subject. The strain formed a round ivory-coloured colony and cells were chained rods with tapered ends, approximately 2.0–2.5×0.6–0.8 μm in size. The taxonomic analysis indicated that strain SNUG30386 T was within the family Lachnospiraceae . According to the 16S rRNA gene sequence similarity, the closest species to strain SNUG30386 T was Clostridium symbiosum (95.6 %), followed by Enterocloster asparagiformis (94.8 %), Enterocloster clostridioformis (94.8 %) and Enterocloster lavalensis (94.6 %). The evolutionary tree based on 16S rRNA gene sequences demonstrated that strain SNUG30386 T had split apart at a unique branch point far from other close relatives. Its DNA G+C content was 48.3 mol% calculated from the whole genome sequence. The major cellular fatty acids were C 16 : 0 and C 14 : 0 . Compared to those of the closely related species, strain SNUG30386 T showed distinct biochemical activities such as being unable to utilize most of carbon sources except d -glucose and l -arabinose. As a result, based on its unique phylogenetic clade and taxonomic characteristics, we conclude that strain SNUG30386 T represents a novel species within the genus Clostridium , for which the name Clostridium fessum sp. nov. is proposed. The type strain of the novel species is SNUG30386 T (=KCTC 15633 T = JCM 32258 T ).
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