Diversity characterization and association analysis of agronomic traits in a Chinese peanut (Arachis hypogaea L.) mini-core collection

花生 生物 栽培 遗传多样性 园艺 花生 农学 植物 人口 医学 环境卫生
作者
Huifang,Jiang,Li,Huang,Xiaoping,Ren Ren,Yuning,Chen,Xiaojing,Zhou,You-lin,Xia,Jia-quan,Yong,LEI LEI,LiYing LiYing,Yan,Liyun Liyun,Wan
出处
期刊:植物学报:英文版 卷期号: (2): 159-169 被引量:39
摘要

协会印射是为在植物探索 phenotypic 变化的分子的基础的一条强大的途径。一棵花生(Arachis hypogaea L.) 在包括 298 就职的中国的微型核心收集是用 109 简单顺序重复(SSR ) 的 genotyped 标记,在三不同环境为 15 个农学的特点识别了 554 SSR 等位基因和 phenotyped,展出丰富基因并且在面板以内的 phenotypic 差异。基于模型的结构分析把所有就职分到三个组。大多数就职有不到 0.05 的相对亲戚关系,显示有没有或在微型核心收集的就职之间的弱关系。为在花生面板的 15 个农学的特点,通常, Q+K 模型展出了最好的性能与 Q 模型和一般线性模型简单的模型相比消除假联系 positives。总共, 89 SSR 等位基因被识别被 Q+K 基于模型的协会分析与三环境的 15 个农学的特点联系。这些,八等位基因反复在二或三环境被检测,并且 15 等位基因通常被检测与多重农学的特点被联系。突变而产生之遗传的效果证实了的简单顺序重复这些的不同遗传型之间的重要差别反复检测了标记。我们的结果表明集成协会分析并且由利用花生微型核心收集的帮助标记的繁殖的大潜力。
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