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Generation of a Set of Simple, Interpretable ADMET Rules of Thumb

化学 经验法则 极表面积 溶解度 赫尔格 李宾斯基五定律 生物利用度 计算化学 分子 生物物理学 生物化学 药理学 有机化学 算法 钾通道 计算机科学 基因 生物信息学 生物 医学
作者
M. Paul Gleeson
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:51 (4): 817-834 被引量:864
标识
DOI:10.1021/jm701122q
摘要

A set of simple, consistent structure-property guides have been determined from an analysis of a number of key ADMET assays run within GSK: solubility, permeability, bioavailability, volume of distribution, plasma protein binding, CNS penetration, brain tissue binding, P-gp efflux, hERG inhibition, and cytochrome P450 1A2/2C9/2C19/2D6/3A4 inhibition. The rules have been formulated using molecular properties that chemists intuitively know how to alter in a molecule, namely, molecular weight, logP, and ionization state. The rules supplement the more predictive black-box models available to us by clearly illustrating the key underlying trends, which are in line with reports in the literature. It is clear from the analyses reported herein that almost all ADMET parameters deteriorate with either increasing molecular weight, logP, or both, with ionization state playing either a beneficial or detrimental affect depending on the parameter in question. This study re-emphasizes the need to focus on a lower molecular weight and logP area of physicochemical property space to obtain improved ADMET parameters.
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