A machine-vision-based frailty index for mice

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作者
Leinani Hession,Gautam Sabnis,Gary A. Churchill,Vivek Kumar
出处
期刊:Nature Aging 卷期号:2 (8): 756-766 被引量:20
标识
DOI:10.1038/s43587-022-00266-0
摘要

Heterogeneity in biological aging manifests itself in health status and mortality. Frailty indices (FIs) capture health status in humans and model organisms. To accelerate our understanding of biological aging and carry out scalable interventional studies, high-throughput approaches are necessary. Here we introduce a machine-learning-based visual FI for mice that operates on video data from an open-field assay. We use machine vision to extract morphometric, gait and other behavioral features that correlate with FI score and age. We use these features to train a regression model that accurately predicts the normalized FI score within 0.04 ± 0.002 (mean absolute error). Unnormalized, this error is 1.08 ± 0.05, which is comparable to one FI item being mis-scored by 1 point or two FI items mis-scored by 0.5 points. This visual FI provides increased reproducibility and scalability that will enable large-scale mechanistic and interventional studies of aging in mice. The authors introduce a high-throughput machine-learning-based visual frailty index for mice that operates on video data from an open-field assay. The machine-vision-based approach extracts various morphometric and behavioral features from video to model frailty score and age.
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