DefensePredictor: A machine learning model to discover prokaryotic immune systems

计算生物学 基因组 先天免疫系统 生物 系统生物学 同源(生物学) 三域系统 免疫系统 序列同源性 计算机科学 人工智能 免疫识别 基因组学 机器学习 免疫 病毒感染 细菌蛋白 生物分类 生物进化 模型系统 模式生物
作者
Peter C. DeWeirdt,Emily M. Mahoney,Michael T. Laub
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science]
卷期号:392 (6793): eadv7924-eadv7924 被引量:2
标识
DOI:10.1126/science.adv7924
摘要

strains, we predicted hundreds of previously unknown systems and experimentally validated 42 of them. Analysis of 1000 diverse prokaryotic genomes identified nearly 3000 protein clusters lacking homology to known systems, revealing a vast, uncharacterized defense repertoire. DefensePredictor will facilitate the comprehensive discovery of antiphage defense systems, which promises to reveal additional connections between prokaryotic and eukaryotic immunity and accelerate biotechnology development.
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