Effects of Hydrophobic Residues on the Intracellular Self-Assembly of De Novo Designed Peptide Tags and Their Orthogonality

细胞质 正交性 背景(考古学) 生物物理学 细胞内 氨基酸 蛋白质工程 肽序列 化学 自组装 生物化学
作者
Takayuki Miki,Keigo Kajiwara,Sae Nakayama,Masahiro Hashimoto,Hisakazu Mihara
出处
期刊:ACS Synthetic Biology [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/acssynbio.2c00058
摘要

Protein assemblies forming nano- to micro-sized structures underlie versatile biological events in living systems. For mimicking and engineering these protein assemblies through a bottom-up approach, self-assembling peptides (SAPs) that form nanofibril structures via β-sheets serve as potential practical tags. Nevertheless, the development of SAP tags is still in its infancy, and insight into the relationship between peptide sequences and intracellular self-assembly is limited. In this study, we focused on hydrophobic residues in SAPs and examined the self-assembly of SAP-tagged superfolder GFPs (green fluorescent proteins) in COS-7 cells. Based on XEXK (X; hydrophobic amino acids: F, L, I, V, W, or Y) sequence units, we designed a panel of Xn peptides with different hydrophobic residues (X) and chain lengths (n). We observed that the self-assembly propensity, the size of the assemblies, the influence on protein denaturation, and the subcellular localization differed significantly depending on the hydrophobic amino acid. F9, L9, I7, and V13 peptides formed μm-scaled granules, W13 formed small oligomeric clusters in the cytoplasm, and Y15 formed assemblies in the nucleus. In addition, we investigated the orthogonality of their interaction. Strikingly, W13- and Y15-tagged proteins interacted independently and formed two distinct assemblies in cells. Herein, we have demonstrated the great opportunities for rationalizing artificial protein assemblies and orthogonal structures in an intracellular context using the designed SAPs.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
马香芦完成签到,获得积分10
3秒前
美满的皮卡丘完成签到 ,获得积分10
4秒前
科研张完成签到 ,获得积分10
4秒前
小马完成签到 ,获得积分10
12秒前
鬼见愁应助科研通管家采纳,获得10
15秒前
在水一方应助科研通管家采纳,获得10
15秒前
19秒前
科研通AI2S应助刘隅采纳,获得10
22秒前
研友_LN32Mn发布了新的文献求助10
26秒前
缺粥完成签到 ,获得积分10
29秒前
莫冰雪完成签到 ,获得积分10
32秒前
EVEN完成签到 ,获得积分10
39秒前
zwzxtx完成签到 ,获得积分10
43秒前
Huang完成签到 ,获得积分0
44秒前
ryan1300完成签到 ,获得积分10
46秒前
Amikacin完成签到,获得积分10
51秒前
烟熏妆的猫完成签到 ,获得积分10
52秒前
Diligency完成签到 ,获得积分10
56秒前
笨笨青筠完成签到 ,获得积分10
59秒前
无为完成签到 ,获得积分10
1分钟前
失眠的安卉完成签到,获得积分10
1分钟前
小彭友完成签到 ,获得积分10
1分钟前
江流有声完成签到 ,获得积分10
1分钟前
xiao完成签到 ,获得积分10
1分钟前
su完成签到 ,获得积分10
1分钟前
logolush完成签到 ,获得积分10
1分钟前
zhang完成签到 ,获得积分10
1分钟前
zhdjj完成签到 ,获得积分10
1分钟前
sydhwo完成签到 ,获得积分10
1分钟前
无极2023完成签到 ,获得积分10
1分钟前
特别圆的正方形完成签到 ,获得积分10
1分钟前
iShine完成签到 ,获得积分10
1分钟前
会发芽完成签到 ,获得积分10
1分钟前
CC2333完成签到 ,获得积分10
1分钟前
卓矢完成签到 ,获得积分10
1分钟前
jue完成签到 ,获得积分10
2分钟前
GuangboXia完成签到,获得积分10
2分钟前
研友_LN32Mn完成签到,获得积分10
2分钟前
yinhe完成签到 ,获得积分10
2分钟前
Singularity应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
高分求助中
좌파는 어떻게 좌파가 됐나:한국 급진노동운동의 형성과 궤적 2500
Sustainability in Tides Chemistry 1500
TM 5-855-1(Fundamentals of protective design for conventional weapons) 1000
Cognitive linguistics critical concepts in linguistics 800
Threaded Harmony: A Sustainable Approach to Fashion 799
Livre et militantisme : La Cité éditeur 1958-1967 500
氟盐冷却高温堆非能动余热排出性能及安全分析研究 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3052652
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2709874
关于积分的说明 7418267
捐赠科研通 2354446
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1246020
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 605951
版权声明 595921