Structural and thermostability insights into cellobiohydrolase of a thermophilic mould Myceliophthora thermophila: in-silico studies

热稳定性 生物信息学 嗜热菌 化学 生物化学 纤维二糖 计算生物学 生物 纤维素酶 基因
作者
Anica Dadwal,Vishal Singh,Shilpa Sharma,Amaresh Kumar Sahoo,T. Satyanarayana
出处
期刊:Journal of Biomolecular Structure & Dynamics [Taylor & Francis]
卷期号:41 (17): 8373-8382 被引量:2
标识
DOI:10.1080/07391102.2022.2133012
摘要

Cellobiohydrolase (CBH) is one of the cellulases with a wide range of industrial applications; it plays a pivotal role in cellulose hydrolysis and thus in biofuel production. The structural and thermostability analysis of a CBHII of the thermophilic mold Myceliophthora thermophila (MtCel6A) had been carried out using various in-silico approaches. The validation of 3 D model by the Ramachandran plot indicated 88.5% amino acid residues in the favoured regions. Docking analysis suggested MtCel6A to display a high affinity towards cellotetraose as compared to other substrates. The enzyme exhibited a high tolerance to the end product, cellobiose. The thermostability evaluation by molecular dynamic simulations and principal component analysis confirmed its tolerance to elevated temperatures. The identified thermolabile regions could be targeted for site-directed mutagenesis in order to ameliorate thermostability further. Our experimental data published earlier confirmed the present findings of in-silico studies. The structural and functional characteristics of MtCel6A highlighted its critical features that make it a useful biocatalyst in several industrial processes.Communicated by Ramaswamy H. Sarma

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