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CRISPR/Cas9介导的猪IPEC-J2细胞 CD 13基因敲除细胞系的建立

清脆的 生物 计算生物学 遗传学 计算机科学 基因
作者
王晓朋,Xiaopeng Wang,徐奎,Kui Xu,魏迎辉,Wei Ying-hui,张秀玲,Xiuling Zhang,刘莎莎,Shasha Liu,邱乙卿,Qiu Yiqing,刘颖,Ying Liu,赵海全,Zhao Haiquan,牟玉莲,MU Yulian,李奎,Kui Li
出处
期刊:畜牧兽医学报 卷期号:50 (7): 1319-1327
标识
DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2019.07.001
摘要

旨在利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术制备CD13基因敲除的IPEC-J2(猪空肠上皮细胞系)细胞,揭示细胞表面分化抗原13(cluster of differentiation 13,CD13)在肠道病原微生物感染肠道细胞中所起的作用。本研究在猪CD13基因第2外显子区域设计2个向导RNA(guide RNA,gRNA),命名为g3、g5,然后分别将g3和g5克隆到pX330-GFP和pX330-RFP载体骨架上,电转染IPEC-J2细胞,48 h后通过流式细胞术分选具有双荧光标记的细胞,培养并获得单克隆细胞,PCR扩增、测序,从而获得CD13基因纯合敲除的阳性细胞系。对获得的20个细胞单克隆进行PCR,并挑取部分克隆PCR产物测序,发现共有7个克隆发生了基因片段缺失,其中1个克隆为单等位基因片段缺失,3个克隆为双等位基因杂合片段缺失,3个克隆为双等位基因纯合片段敲除。本研究检测双等位基因纯合片段敲除细胞的蛋白表达水平,其结果显示,在该纯合敲除细胞中CD13蛋白几乎不表达,表明成功构建了CD13敲除的IPEC-J2细胞系。本研究获得的CD13基因敲除细胞系为探究CD13在猪肠道病原微生物感染肠道细胞中所起的作用奠定了基础。

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