Design, Synthesis, and Characterization of I-BET567, a Pan-Bromodomain and Extra Terminal (BET) Bromodomain Oral Candidate

溴尿嘧啶 终端(电信) 化学 计算生物学 表观遗传学 立体化学 生物化学 生物 基因 计算机网络 计算机科学
作者
P. G. Humphreys,Stephen J. Atkinson,Paul Bamborough,Rino A. Bit,Chun‐wa Chung,Peter D. Craggs,Leanne Cutler,Rob P. Davis,Alan Ferrie,Gangli Gong,Laurie Gordon,Matthew Gray,Lee A. Harrison,Thomas G. Hayhow,Andrea Haynes,Nick Henley,David J. Hirst,Ian D. Holyer,Matthew Lindon,Cerys Lovatt
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:65 (3): 2262-2287 被引量:20
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.1c01747
摘要

Through regulation of the epigenome, the bromodomain and extra terminal (BET) family of proteins represent important therapeutic targets for the treatment of human disease. Through mimicking the endogenous N-acetyl-lysine group and disrupting the protein–protein interaction between histone tails and the bromodomain, several small molecule pan-BET inhibitors have progressed to oncology clinical trials. This work describes the medicinal chemistry strategy and execution to deliver an orally bioavailable tetrahydroquinoline (THQ) pan-BET candidate. Critical to the success of this endeavor was a potency agnostic analysis of a data set of 1999 THQ BET inhibitors within the GSK collection which enabled identification of appropriate lipophilicity space to deliver compounds with a higher probability of desired oral candidate quality properties. SAR knowledge was leveraged via Free–Wilson analysis within this design space to identify a small group of targets which ultimately delivered I-BET567 (27), a pan-BET candidate inhibitor that demonstrated efficacy in mouse models of oncology and inflammation.

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