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Interaction-aware Drug Package Recommendation via Policy Gradient

计算机科学 判别式 药物与药物的相互作用 强化学习 机器学习 药物重新定位 人工智能 药品 人工神经网络 过程(计算) 数据挖掘 药理学 医学 操作系统
作者
Zhi Zheng,Chao Wang,Tong Xu,D. Z. Shen,Penggang Qin,Xiangyu Zhao,Baoxing Huai,Xian Wu,Enhong Chen
出处
期刊:ACM Transactions on Information Systems [Association for Computing Machinery]
卷期号:41 (1): 1-32 被引量:44
标识
DOI:10.1145/3511020
摘要

Recent years have witnessed the rapid accumulation of massive electronic medical records, which highly support intelligent medical services such as drug recommendation. However, although there are multiple interaction types between drugs, e.g., synergism and antagonism, which can influence the effect of a drug package significantly, prior arts generally neglect the interaction between drugs or consider only a single type of interaction. Moreover, most existing studies generally formulate the problem of package recommendation as getting a personalized scoring function for users, despite the limits of discriminative models to achieve satisfactory performance in practical applications. To this end, in this article, we propose a novel end-to-end Drug Package Generation (DPG) framework, which develops a new generative model for drug package recommendation that considers the interaction effects between drugs that are affected by patient conditions. Specifically, we propose to formulate the drug package generation as a sequence generation process. Along this line, we first initialize the drug interaction graph based on medical records and domain knowledge. Then, we design a novel message-passing neural network to capture the drug interaction, as well as a drug package generator based on a recurrent neural network. In detail, a mask layer is utilized to capture the impact of patient condition, and the deep reinforcement learning technique is leveraged to reduce the dependence on the drug order. Finally, extensive experiments on a real-world dataset from a first-rate hospital demonstrate the effectiveness of our DPG framework compared with several competitive baseline methods.
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