Computational screening of disease associated mutations on NPC1 gene and its structural consequence in Niemann-Pick type-C1

Niemann 精选疾病类型 C1 (NPC1 ) ，由 NPC1 基因的变化引起了，是继承 lysosomal 类脂化合物存储混乱。功能的 NPC1 的损失在近来包括了特征的 endocytic 细胞器引起免费胆固醇(FC ) 的累积内涵体或 lysosomes。在这研究，我们分析了用计算方法在 NPC1 报导的 103 nsSNPs 的病原的效果。当有害的大多数和与 NPC1 使用联系的疾病筛， R1186C， S940L， R958Q 和 I1061T 变化被预言，是的 Polyphen 2.0，美洲豹， PhD-SNP， Pmut 和 MUTPred 工具也资助了与以前的在里面 vivo 试验性的研究。为了在 3D 理解原子安排，联系异种(R1186C， S940L， R958Q 和 I1061T ) 组织的空间，土著人和疾病被建模。量结构并且灵活性分析被承认观察到按优先级排列的疾病的结构的后果联系了变化(R1186C， S940L， R958Q 和 I1061T ) 。可存取的表面区域(ASA ) ，免费合拢精力(FFE ) 和氢债券(NH 契约) 在变异的结构在 3D 空间显示出更多的灵活性。基于量的评价和 NPC1 变体的灵活性分析， I1061T 显示出最有害的效果。我们的分析提供清楚的线索弄湿实验室科学家在变化之上理解 NPC1 基因的结构、功能的效果。