Phase separation of SERRATE drives dicing body assembly and promotes miRNA processing in Arabidopsis.

细胞生物学 生物 拟南芥 小RNA 计算生物学
作者
Dongqi Xie,Min Chen,Jinrong Niu,Liang Wang,Yan Li,Xiaofeng Fang,Pilong Li,Yijun Qi
出处
期刊:Nature Cell Biology [Springer Nature]
卷期号:23 (1): 32-39 被引量:21
标识
DOI:10.1038/s41556-020-00606-5
摘要

MicroRNA (miRNA) production entails the step-wise processing of primary miRNAs (pri-miRNAs) into precursor miRNAs (pre-miRNAs) and miRNA/* duplexes by Dicing complexes containing DCL1, HYL1 and SE, which are localized in nuclear dicing bodies (D-bodies)1,2. Here, we show that D-bodies are phase-separated condensates. SE forms droplets and drives DCL1, HYL1 and pri/pre-miRNAs into the droplets in vitro, and mutation of SE abrogates the formation of D-bodies in vivo, which indicates that D-bodies arise through SE-mediated phase separation. Disruption of SE phase separation greatly reduces its activity in promoting miRNA processing both in vitro and in vivo. We further show that pre-miRNAs are processed into miRNA/* duplexes in the droplets and, after processing, miRNA/* duplexes are bound by HYL1 and released from the droplets. Our findings provide evidence that efficient miRNA processing depends on the SE-phase-separation-mediated formation of D-bodies and suggest a paradigm that the products made in phase-separated condensates can be shipped out for subsequent processes.
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