Holtiella tumoricola gen. nov. sp. nov., isolated from a human clinical sample

生物 16S核糖体RNA 酵母抽提物 细菌 拉伤 微生物学 核糖体RNA 酵母 基因 生物化学 遗传学 解剖
作者
Emma Allen‐Vercoe,Michelle C. Daigneault,Sarah J. Vancuren,Kyla Cochrane,Lindsey L. O’Neal,Krithivasan Sankaranarayanan,Paul A. Lawson
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:73 (7) 被引量:2
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005958
摘要

The diversity of bacteria associated with biopsy material obtained from patients with colorectal cancer was investigated using culture techniques. A novel bacterium, strain CC70A T , was isolated by diluting a sample of homogenized tissue in anaerobic medium, and then plating to yield a pure culture. Strain CC70A T was a Gram-positive, strictly anaerobic, motile, rod-shaped bacterium. Formate, but not acetate, was a fermentative end-product from growth in peptone–yeast extract and peptone–yeast–glucose broth. The G+C content of DNA from strain CC70A T was 34.9 mol%. 16S rRNA gene sequence analysis revealed that the isolate was part of the phylum Bacillota . The closest described relatives of strain CC70A T were Cellulosilyticum lentocellum (93.3 %) and Cellulosilyticum ruminicola (93.3 and 91.9% sequence similarity across 16S rRNA gene, respectively). According to the data obtained in this work, strain CC70A T represents a novel bacterium belonging to a new genus for which the name Holtiella tumoricola gen. nov., sp. nov. is proposed. The type strain for our described novel species is CC70A T (=DSM 27931 T = JCM 30568 T ).

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