Large-scale multitrait genome-wide association analyses identify hundreds of glaucoma risk loci

全基因组关联研究 生物 青光眼 遗传关联 遗传力缺失问题 遗传力 遗传学 眼压 开角型青光眼 单核苷酸多态性 医学 眼科 基因型 基因 神经科学
作者
Xikun Han,Puya Gharahkhani,Andrew R. Hamel,Jue‐Sheng Ong,Miguel E. Rentería,Puja A. Mehta,Xianjun Dong,Francesca Pasutto,Christopher J. Hammond,Terri L. Young,Pirro G. Hysi,Andrew Lotery,Eric Jorgenson,Hélène Choquet,Michael A. Hauser,Jessica N. Cooke Bailey,Toru Nakazawa,Masato Akiyama,Yukihiro Shiga,Zachary L. Fuller
出处
期刊:Nature Genetics [Springer Nature]
卷期号:55 (7): 1116-1125 被引量:94
标识
DOI:10.1038/s41588-023-01428-5
摘要

Abstract Glaucoma, a leading cause of irreversible blindness, is a highly heritable human disease. Previous genome-wide association studies have identified over 100 loci for the most common form, primary open-angle glaucoma. Two key glaucoma-associated traits also show high heritability: intraocular pressure and optic nerve head excavation damage quantified as the vertical cup-to-disc ratio. Here, since much of glaucoma heritability remains unexplained, we conducted a large-scale multitrait genome-wide association study in participants of European ancestry combining primary open-angle glaucoma and its two associated traits (total sample size over 600,000) to substantially improve genetic discovery power (263 loci). We further increased our power by then employing a multiancestry approach, which increased the number of independent risk loci to 312, with the vast majority replicating in a large independent cohort from 23andMe, Inc. (total sample size over 2.8 million; 296 loci replicated at P < 0.05, 240 after Bonferroni correction). Leveraging multiomics datasets, we identified many potential druggable genes, including neuro-protection targets likely to act via the optic nerve, a key advance for glaucoma because all existing drugs only target intraocular pressure. We further used Mendelian randomization and genetic correlation-based approaches to identify novel links to other complex traits, including immune-related diseases such as multiple sclerosis and systemic lupus erythematosus.
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