Genome-Wide Identification of AP2/ERF Transcription Factor Family and Functional Analysis of DcAP2/ERF#96 Associated with Abiotic Stress in Dendrobium catenatum

生物 转录因子 拟南芥 基因 亚科 基因家族 遗传学 非生物胁迫 系统发育树 基因组 突变体
作者
Yuliang Han,Maohong Cai,Siqi Zhang,Jiawen Chai,Mingzhe Sun,Yingwei Wang,Qinyu Xie,Youheng Chen,Huizhong Wang,Tao Chen
出处
期刊:International Journal of Molecular Sciences [Multidisciplinary Digital Publishing Institute]
卷期号:23 (21): 13603-13603 被引量:30
标识
DOI:10.3390/ijms232113603
摘要

APETALA2/Ethylene Responsive Factor (AP2/ERF) family plays important roles in reproductive development, stress responses and hormone responses in plants. However, AP2/ERF family has not been systematically studied in Dendrobium catenatum. In this study, 120 AP2/ERF family members were identified for the first time in D. catenatum, which were divided into four groups (AP2, RAV, ERF and DREB subfamily) according to phylogenetic analysis. Gene structures and conserved motif analysis showed that each DcAP2/ERF family gene contained at least one AP2 domain, and the distribution of motifs varied among subfamilies. Cis-element analysis indicated that DcAP2/ERF genes contained abundant cis-elements related to hormone signaling and stress response. To further identify potential genes involved in drought stress, 12 genes were selected to detect their expression under drought treatment through qRT-PCR analysis and DcAP2/ERF#96, a nuclear localized ethylene-responsive transcription factor, showed a strong response to PEG treatment. Overexpression of DcAP2/ERF#96 in Arabidopsis showed sensitivity to ABA. Molecular, biochemical and genetic assays indicated that DcAP2ERF#96 interacts with DREB2A and directly inhibits the expression of P5CS1 in response to the ABA signal. Taken together, our study provided a molecular basis for the intensive study of DcAP2/ERF genes and revealed the biological function of DcAP2ERF#96 involved in the ABA signal.

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