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MOLECULAR IDENTIFICATION OF ORIGINAL PLANTS OF FRITILLARIAE CIRRHOSAE BULBUS, ATRADTIONAL CHINESE MEDICINE (TCM) USING PLANT DNA BARCODING

DNA条形码 生物 内转录区 条形码 DNA测序 鉴定(生物学) 核糖体DNA 传统医学 DNA 计算生物学 核糖体RNA 系统发育树 植物 遗传学 GenBank公司 物种鉴定 进化生物学 基因 操作系统 计算机科学
作者
Dequan Zhang,Xin-Chun Mo,Jian-Ying Xiang,Nong Zhou
出处
期刊:African Journal of Traditional, Complementary and Alternative Medicines [African Traditional Herbal Medicine Supporters Initiative (ATHMSI)]
卷期号:13 (6): 74-82 被引量:12
标识
DOI:10.21010/ajtcam.v13i6.12
摘要

DNA barcoding is a widely used tool that enables rapid and accurate identification of species based on standardized DNA regions.In this study, potential DNA barcodes, namely three plastid regions (rbcL, trnH-psbA and matK) and one nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) were adopted for species identification of original plants of Fritillariae Cirrhosae Bulbus.The rbcL and trnH-psbA regions showed better success rate of PCR amplification and DNA sequencing, as well as superior discriminatory ability. On the contrary, ITS region did not possess effective genetic variation and matK was faced with low success rate of sequencing. Combination of multi-loci sequences could improve identification ability of DNA barcoding. The trnH-psbA + rbcL could discriminate 25% - 100% species based on the Blast, Tree-Building and Distance methods.The potential DNA barcodes could not completely solving species identification of botanic origins of Fritillariae Cirrhosae Bulbus. In future, we should pay more attention to super-barcoding or specific barcode that enhance ability to discriminate the closely related plants.

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