在癌细胞中观察到的大量异质性，包括基因表达、细胞组成和免疫微环境的差异，对准确诊断和治疗提出了重大挑战。然而，单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST）技术的进步为应对这一挑战提供了有希望的新途径。通过能够以单细胞分辨率解剖癌细胞多样性并弥补源组织空间信息的缺乏，这些发展可以为分析癌症的复杂性提供新的机会。目前，scRNA-seq 和 ST 已揭示了各种组织在各种条件下的转录和空间景观。随着全球大量单细胞数据集的迅速出现，研究人员必须能够访问和解释大规模的癌症基因组学资源。最近建立的单细胞数据库是合成和呈现大量单细胞数据用于研究的有效工具。为了利用从ST（26）、MERFISH（27）和Visium（28）等高通量方法获得的细胞位置，中国医学科学院团队构建了单细胞和空间分辨癌症资源（SCAR）数据库（http://scaratlas.com），该数据库包含广泛的癌症相关资源。该数据库包括两个不同的组成部分：SCAR_ST，一个空间转录组图谱，包含来自21个肿瘤组织的数据，SCAR_Atlas，包含395个癌症亚型的单细胞图谱。设计了用于筛选肿瘤生物标志物和分析基因表达模式的其他模块。通过对公开可用的癌症数据集的广泛分析，SCAR作为癌症基因组学的多功能在线平台，使用户能够在组织、细胞和基因水平上揭示癌症的复杂性。
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(2025-6-4)
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