A taxonomic note on the order Caryophanales: description of 12 novel families and emended description of 21 families

生物 进化生物学 分类学(生物学) 基因组 谱系(遗传) 系统发育学 计算生物学 遗传学 基因 动物
作者
Yangjie Li,De-Chao Zhang,Dexin Bo,Donghai Peng,Ming Sun,Jinshui Zheng
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:74 (11) 被引量:5
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006539
摘要

The order Caryophanales , belonging to class Bacilli , is globally distributed in various ecosystems. Currently, this order comprised 12 families that show vast phenotypic, ecological and genotypic variation. The classification of Caryophanales at the family level is currently mainly based on 16S rRNA gene sequencing analysis and the presence of shared phenotypic characteristics, resulting in noticeable anomalies. Our present study revises the taxonomy of Caryophanales based on 1080 available high-quality genome sequences of type strains. The evaluated parameters included the core-genome phylogeny, pairwise average aa identity, lineage-specific core genes, physiological criteria and ecological parameters. Based on the results of this polyphasic approach, we propose that the order Caryophanales be reclassified into 41 families, which include the existing 12 families, 17 families in a recent Validation List in the IJSEM (Validation List no. 215) and 12 novel families for which we propose the names Aureibacillaceae , Cytobacillaceae , Domibacillaceae , Falsibacillaceae , Heyndrickxiaceae , Lottiidibacillaceae , Oxalophagaceae , Pradoshiaceae , Rossellomoreaceae , Schinkiaceae , Sulfoacidibacillaceae and Sutcliffiellaceae . This work represents a genomic sequence-based and systematic framework for classifying the order Caryophanales at the family level, providing new insights into its evolution.
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