Transcriptome analysis reveals the peptide toxins diversity of Macrothele palpator venom

毒液 生物 蜘蛛毒素 计算生物学 转录组 同源(生物学) 毒素 蜘蛛 表达序列标记 cDNA文库 序列分析 基因 肽序列 遗传学 互补DNA 生物化学 基因表达 受体 生态学 谷氨酸受体
作者
Xin Xiao,Xiaoqing Luo,Cuiling Huang,Xujun Feng,Meijing Wu,Minjuan Lu,J. C. Kuang,Siyi Peng,Yingmei Guo,Zixuan Zhang,Zhaotun Hu,Xi Zhou,Minzhi Chen,Zhonghua Liu
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier BV]
卷期号:253: 126577-126577 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.126577
摘要

Spider venom is a large pharmacological repertoire of different bioactive peptide toxins. However, obtaining crude venom from some spiders is challenging. Thus, studying individual toxins through venom purification is a daunting task. In this study, we constructed the cDNA library and transcriptomic sequencing from the Macrothele palpator venom glands. Subsequently, 718 high-quality expressed sequence tags (ESTs) were identified, and grouped into three categories, including 449 toxin-like (62.53 %), 136 cellular component (18.94 %) and 133 non-matched (18.52 %) based on the gene function annotation. Additionally, 112 non-redundant toxin-like peptides were classified into 13 families (families A-M) based on their sequence homology and cysteine framework. Bioinformatics analysis revealed a high sequence similarity between families A-J and the toxins from Macrothele gigas in the NR database. In contrast, families K-M had a generally low sequence homology with known spider peptide toxins and unpredictable biological functions. Taken together, this study adds many new members to the spider toxin superfamily and provides a basis for identifying various potential biological tools in M. palpator venom.
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