Deciphering the thiolactonization mechanism in thiolactomycin biosynthesis

机制(生物学) 生物合成 计算生物学 进化生物学 生物 遗传学 基因 哲学 认识论
作者
Jiawei Guo,Qiaoyu Zhang,Fangyuan Cheng,Moli Sang,Xuan Wang,Hao‐Bing Yu,Bo Hu,Sheng Wang,Liangzhen Zheng,Ce Geng,Chaofan Yang,Lianzhong Luo,Gang Zhang,Lei Du,Wei Zhang,Binju Wang,Shengying Li,Xingwang Zhang
标识
DOI:10.1101/2024.12.18.629141
摘要

Thiolactomycin (1), which features a unique gama-thiolactone ring, is a promising antibiotic candidate that specifically targets bacterial type II fatty acid synthase. Despite extensive studies on its pharmacological activities, modes of action, and chemical synthesis, the enzymatic processes responsible for forming the activity-determining gama-thiolactone ring have remained largely unknown. Here, we resolve this problem by revealing that the condensation and heterocyclization (Cy) domain of the nonribosomal peptide synthetase (NRPS) TlnC (TlnCCy), along with the cytochrome P450 enzyme TlnA, cooperatively enable the gama-thiolactone assembly. TlnCCy mediates an unusual sulfurtransfer reaction to sulfurate the polyketide intermediate, generating a thiocarboxyl intermediate. Subsequently, TlnA acts as a gama-thiolactone synthase, converting the linear thiocarboxyl intermediate into 1 via a distal radical-based cyclization mechanism. These findings not only expand the functional and catalytic repertoires of NRPS Cy domains and P450 enzymes, but also highlight a special enzymatic strategy for gama-thiolactone biosynthesis in nature.
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