已入深夜,您辛苦了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!祝你早点完成任务,早点休息,好梦!

Draft genome sequence of an NDM-1-, OXA-421- and AmpC-producing Acinetobacter pittii ST220 in Anhui Province, China

基因组 生物 全基因组测序 质粒 基因 DNA测序 遗传学 基因组DNA GC含量 计算生物学 微生物学
作者
Yuchen Zhang,Shusheng Zhou
出处
期刊:Journal of global antimicrobial resistance [Elsevier]
卷期号:14: 176-177 被引量:6
标识
DOI:10.1016/j.jgar.2018.07.008
摘要

Acinetobacter pittii carrying the blaNDM-1 gene is frequently reported in the world recently, however most of the blaNDM-1 genes are located on plasmids. Here we report a multidrug-resistant (MDR) A. pittii isolated in China co-harbouring blaNDM-1, blaOXA-421 and blaAmpC in the genome. Bacterial genomic DNA was extracted using the cetyl trimethylammonium bromide (CTAB) method. Whole-genome sequencing of A. pittii was performed using an Illumina MiSeq system (2 × 251 bp) in combination with PacBio single-molecule real-time (SMRT) sequencing. De novo genome assembly was performed using SPAdes v.3.9.0, A5-miseq v.20150522 and Canu v.1.4, respectively. The genome sequence was analysed by bioinformatics methods. The 4 211 131-bp genome with 38.99% G + C content displayed several resistance genes, including blaNDM-1, blaOXA-421 and blaAmpC. Meanwhile, 4426 protein-coding sequences were predicted within the genome. The genome sequence reported here can be compared with the already published genomes of NDM-1-producing isolates. These data might facilitate further understanding of the specific genomic feature of MDR A. pittii in China.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
5秒前
kjding发布了新的文献求助10
5秒前
一一完成签到 ,获得积分10
5秒前
JavedAli完成签到,获得积分10
9秒前
baibr完成签到,获得积分10
12秒前
书生也是小郎中完成签到 ,获得积分10
15秒前
Doraemon完成签到 ,获得积分10
17秒前
xiami发布了新的文献求助10
18秒前
思源应助光亮夏槐采纳,获得10
18秒前
Suerte完成签到 ,获得积分0
18秒前
19秒前
贪玩元晴发布了新的文献求助10
23秒前
25秒前
忧郁凡灵完成签到,获得积分10
25秒前
亲爱的知知小姐完成签到,获得积分10
26秒前
27秒前
1391451653完成签到,获得积分10
28秒前
852应助xiami采纳,获得10
28秒前
yan完成签到 ,获得积分20
34秒前
zstyry9998完成签到,获得积分10
36秒前
youngster00发布了新的文献求助10
36秒前
kjding发布了新的文献求助10
38秒前
淡水鱼完成签到 ,获得积分10
44秒前
CodeCraft应助朴实寻真采纳,获得10
45秒前
好耶完成签到 ,获得积分10
45秒前
顺心绝山应助shmily采纳,获得10
48秒前
chang完成签到 ,获得积分10
48秒前
杨二锤完成签到 ,获得积分10
50秒前
卡马西平007完成签到,获得积分10
52秒前
GT完成签到,获得积分10
54秒前
留白完成签到 ,获得积分10
55秒前
GRG完成签到 ,获得积分10
55秒前
斯文凡阳发布了新的文献求助10
56秒前
56秒前
shinysparrow应助贪玩元晴采纳,获得10
57秒前
勿昂完成签到 ,获得积分10
59秒前
cach完成签到,获得积分10
59秒前
665完成签到 ,获得积分10
59秒前
思源应助NCMer1采纳,获得10
1分钟前
1分钟前
高分求助中
Manual of Clinical Microbiology, 4 Volume Set (ASM Books) 13th Edition 1000
Edestus (Chondrichthyes, Elasmobranchii) from the Upper Carboniferous of Xinjiang, China 500
Chinese-English Translation Lexicon Version 3.0 500
Electronic Structure Calculations and Structure-Property Relationships on Aromatic Nitro Compounds 500
マンネンタケ科植物由来メロテルペノイド類の網羅的全合成/Collective Synthesis of Meroterpenoids Derived from Ganoderma Family 500
Two-sample Mendelian randomization analysis reveals causal relationships between blood lipids and venous thromboembolism 400
薩提亞模式團體方案對青年情侶輔導效果之研究 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 有机化学 工程类 生物化学 纳米技术 物理 内科学 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 电极 光电子学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 2380864
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2088159
关于积分的说明 5243970
捐赠科研通 1815163
什么是DOI,文献DOI怎么找? 905666
版权声明 558810
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 483591