Analysis of the Human Adult Urinary Metabolome Variations with Age, Body Mass Index, and Gender by Implementing a Comprehensive Workflow for Univariate and OPLS Statistical Analyses

代谢组 代谢组学 单变量 代谢物 混淆 单变量分析 尿 OPL公司 队列 多元分析 生物 多元统计 化学 生物信息学 内科学 医学 统计 数学 有机化学 氢键 分子
作者
Etienne Thévenot,Aurélie Roux,Ying Xu,Éric Ezan,Christophe Junot
出处
期刊:Journal of Proteome Research [American Chemical Society]
卷期号:14 (8): 3322-3335 被引量:1154
标识
DOI:10.1021/acs.jproteome.5b00354
摘要

Urine metabolomics is widely used for biomarker research in the fields of medicine and toxicology. As a consequence, characterization of the variations of the urine metabolome under basal conditions becomes critical in order to avoid confounding effects in cohort studies. Such physiological information is however very scarce in the literature and in metabolomics databases so far. Here we studied the influence of age, body mass index (BMI), and gender on metabolite concentrations in a large cohort of 183 adults by using liquid chromatography coupled with high-resolution mass spectrometry (LC-HRMS). We implemented a comprehensive statistical workflow for univariate hypothesis testing and modeling by orthogonal partial least-squares (OPLS), which we made available to the metabolomics community within the online Workflow4Metabolomics.org resource. We found 108 urine metabolites displaying concentration variations with either age, BMI, or gender, by integrating the results from univariate p-values and multivariate variable importance in projection (VIP). Several metabolite clusters were further evidenced by correlation analysis, and they allowed stratification of the cohort. In conclusion, our study highlights the impact of gender and age on the urinary metabolome, and thus it indicates that these factors should be taken into account for the design of metabolomics studies.
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