Chemical shift driven geometry optimization

作者
Raiker Witter,Wolfram Prie,Ulrich Sternberg
出处
期刊:Journal of Computational Chemistry [Wiley]
卷期号:23 (2): 298-305 被引量:27
标识
DOI:10.1002/jcc.10012
摘要

A new method for refinement of 3D molecular structures by geometry optimization is presented. Prerequisites are a force field and a very fast procedure for the calculation of chemical shifts in every step of optimization. To the energy, provided by the force field (COSMOS force field), a pseudoenergy, depending on the difference between experimental and calculated chemical shifts, is added. In addition to the energy gradients, pseudoforces are computed. This requires the derivatives of the chemical shifts with respect to the coordinates. The pseudoforces are analytically derived from the integral expressions of the bond polarization theory. Single chemical shift values attributed to corresponding atoms are considered for structural correction. As a first example, this method is applied for proton position refinement of the D-mannitol X-ray structure. A crystal structure refinement with 13C chemical shift pseudoforces is carried out.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
高夏楠完成签到 ,获得积分10
刚刚
吐个泡泡完成签到,获得积分10
刚刚
刚刚
李晨溪完成签到,获得积分10
刚刚
单薄的哲瀚完成签到,获得积分10
1秒前
xiaosusu完成签到,获得积分20
1秒前
啦啦的应助被kaio_escolar采纳,获得30
1秒前
1秒前
静oo完成签到,获得积分10
1秒前
聪明de窝瓜完成签到,获得积分10
1秒前
2秒前
2秒前
wsj完成签到 ,获得积分10
2秒前
啊哒吸哇完成签到,获得积分0
2秒前
科研小白完成签到,获得积分10
2秒前
马一凡完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
专注的妍完成签到,获得积分10
3秒前
标致剑鬼发布了新的文献求助10
3秒前
哈哈哈完成签到,获得积分20
3秒前
ccccc完成签到,获得积分10
4秒前
小天发布了新的文献求助10
4秒前
祁雩完成签到 ,获得积分10
4秒前
香菜碗里来完成签到,获得积分10
4秒前
X老师发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
5秒前
无与伦比完成签到,获得积分10
6秒前
科研通AI6.4的应助被xiaohu采纳,获得10
6秒前
Tina发布了新的文献求助30
6秒前
灵巧阑香完成签到,获得积分10
6秒前
DW的应助被月夜采纳,获得10
6秒前
6秒前
6秒前
01完成签到,获得积分10
6秒前
我滴个完成签到,获得积分10
7秒前
wzh完成签到,获得积分10
7秒前
小景毕业完成签到,获得积分10
7秒前
msd2phd完成签到,获得积分10
7秒前
Albert完成签到,获得积分10
7秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Les Mantodea De Guyane 2000
Narrative Disclosure and Earnings Performance: Evidence from R&D Disclosures 1050
Preparation and Properties of Cu-Plated Graphene/Cu Composites 1000
Essays on African writing: A re-evaluation 1000
内視鏡下経鼻経蝶形骨洞手術術後SIADHに対する予防的水制限の安全性と有効性の検討 1000
Problems and Solutions for Integer and Combinatorial Optimization: Building Skills in Discrete Optimization 600
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 计算机科学 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 物理 复合材料 内科学 催化作用 光电子学 人工智能 细胞生物学 无机化学 物理化学 数学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 8003621
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9455439
关于积分的说明 21155396
捐赠科研通 7576410
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3381755
关于科研通互助平台的介绍 2514649
邀请新用户注册赠送积分活动 2416363