Adsorption of Pyrimidin-2-amine (PA) on Graphene Quantum Dots (GQDs): Non-covalent Interaction Study

石墨烯 密度泛函理论 吸附 分子 分子间力 计算化学 分子中的原子 相互作用能 分子轨道 氢键 材料科学 物理化学 化学 纳米技术 化学物理 有机化学
作者
Zakir Ullah,Jyun Jee Kim,Y. Sheena Mary,Xuan Zhan,Hyung Wook Kwon
出处
期刊:Journal of Molecular Liquids [Elsevier]
卷期号:368: 120654-120654 被引量:13
标识
DOI:10.1016/j.molliq.2022.120654
摘要

A detailed theoretical study was implemented on a novel drug molecule “Pyrimidin-2-amine (PA)”. Density functional theory (DFT) and time-dependent density functional theory (TD-DFT) simulations were accomplished to explain the adsorption performance of the PA drug molecule on graphene quantum dots (GQD). Binding and adsorption energy, 4-energy molecular orbitals analysis, charge transfer effect, QTAIM, dipole moment, NLO properties, frontier molecular orbital analysis (FMO), the density of states (DOS), RDG-isosurfaces, UV–Visible, and SERS spectra analysis have been explored while performing the DFT simulations. The total adsorption energy of PA was calculated to be −3.45, –22.48, −20.32, −3.78, and −4.47 Kcal/mol for the corresponding CC-PA, BB-P-PA (where “P” stands for the para position of doped elements), NN-P-PA, BN-O-PA (where “O” stands for the ortho position of doped elements), and BN-P-PA complexes respectively. The intermolecular interaction forces were dogged by the establishment of numerous bond critical points (BCPs), monitored by ring critical points (RCPs) at the midpoint of the interaction state.
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