Toward a Universal Unit for Quantification of Antibiotic Resistance Genes in Environmental Samples

生物 抗生素耐药性 基因 可比性 计算生物学 人类健康 拷贝数变化 基因组 遗传学 生物技术 抗生素 医学 环境卫生 数学 组合数学
作者
Xiaole Yin,Xi Chen,Xiaotao Jiang,Ying Yang,Bing Li,Marcus Ho-Hin Shum,Tommy Tsan‐Yuk Lam,GM Leung,Joan B. Rose,Concepcion Sanchez-Cid,Timothy M. Vogel,Fiona Walsh,Thomas U. Berendonk,Janet Midega,Chibuzor Uchea,Dominic Frigon,Gerard D. Wright,Cornelius Carlos Bezuidenhout,Renata Cristina Picão,Shaikh Ziauddin Ahammad
出处
期刊:Environmental Science & Technology [American Chemical Society]
卷期号:57 (26): 9713-9721 被引量:153
标识
DOI:10.1021/acs.est.3c00159
摘要

Surveillance of antibiotic resistance genes (ARGs) has been increasingly conducted in environmental sectors to complement the surveys in human and animal sectors under the "One-Health" framework. However, there are substantial challenges in comparing and synthesizing the results of multiple studies that employ different test methods and approaches in bioinformatic analysis. In this article, we consider the commonly used quantification units (ARG copy per cell, ARG copy per genome, ARG density, ARG copy per 16S rRNA gene, RPKM, coverage, PPM, etc.) for profiling ARGs and suggest a universal unit (ARG copy per cell) for reporting such biological measurements of samples and improving the comparability of different surveillance efforts.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
无限洋葱完成签到,获得积分10
刚刚
Agulater发布了新的文献求助10
1秒前
closer完成签到 ,获得积分10
1秒前
清圆527发布了新的文献求助10
1秒前
1秒前
Askeladd发布了新的文献求助10
1秒前
lzy完成签到 ,获得积分10
2秒前
3秒前
JamesPei应助卯哲宇采纳,获得10
4秒前
4秒前
4秒前
岳鹏发布了新的文献求助10
4秒前
xiao发布了新的文献求助10
5秒前
小曦瓜完成签到,获得积分10
5秒前
不安映秋完成签到,获得积分10
5秒前
5秒前
7秒前
AAAA发布了新的文献求助10
7秒前
8秒前
9秒前
不安映秋发布了新的文献求助10
9秒前
虎虎虎完成签到,获得积分10
9秒前
9秒前
长安宁完成签到 ,获得积分10
10秒前
10秒前
华仔应助嗯哼哈哈采纳,获得10
10秒前
11秒前
安小安发布了新的文献求助10
12秒前
12秒前
共享精神应助岳鹏采纳,获得10
12秒前
13秒前
彭于晏应助心如止水采纳,获得10
13秒前
quup完成签到,获得积分10
14秒前
Ninest应助lumi采纳,获得50
15秒前
ye摸鱼发布了新的文献求助10
15秒前
思源应助剑走偏锋采纳,获得10
17秒前
英姑应助xiao采纳,获得10
17秒前
CipherSage应助奇趣糖采纳,获得10
17秒前
又声发布了新的文献求助10
17秒前
15发布了新的文献求助10
18秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Römisch-Germanische Forschungen 1000
China Pluperfect I: Epistemology of Past and Outside in Chinese Art 520
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition Second Edition 510
The fast track to determining transfer functions of linear circuits: The student guide 500
The Analytical and Numerical Solution of Electric and Magnetic Fields 500
Green Fire Retardants for Polymeric Materials 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7616812
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9192142
关于积分的说明 19699219
捐赠科研通 7189339
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3271923
关于科研通互助平台的介绍 2434684
邀请新用户注册赠送积分活动 2266915