TULIPs: tunable, light-controlled interacting protein tags for cell biology

PDZ域 生物 酵母 嗜光蛋白 细胞生物学 双杂交筛选 蛋白质-蛋白质相互作用 生物物理学 生物化学 拟南芥 基因 突变体
作者
Devin Strickland,Yuan Lin,Elizabeth Wagner,C Matthew Hope,Josiah P. Zayner,Chloe Antoniou,Tobin R. Sosnick,Eric L. Weiss,Michael Glotzer
出处
期刊:Nature Methods [Nature Portfolio]
卷期号:9 (4): 379-384 被引量:494
标识
DOI:10.1038/nmeth.1904
摘要

Light-inducible dimerization tags are engineered to rapidly recruit proteins to precise points in living yeast and mammalian cells. The affinities and response time of the interactions are tunable, and the authors used the system to activate cell signaling and to direct cell polarization in yeast. Naturally photoswitchable proteins offer a means of directly manipulating the formation of protein complexes that drive a diversity of cellular processes. We developed tunable light-inducible dimerization tags (TULIPs) based on a synthetic interaction between the LOV2 domain of Avena sativa phototropin 1 (AsLOV2) and an engineered PDZ domain (ePDZ). TULIPs can recruit proteins to diverse structures in living yeast and mammalian cells, either globally or with precise spatial control using a steerable laser. The equilibrium binding and kinetic parameters of the interaction are tunable by mutation, making TULIPs readily adaptable to signaling pathways with varying sensitivities and response times. We demonstrate the utility of TULIPs by conferring light sensitivity to functionally distinct components of the yeast mating pathway and by directing the site of cell polarization.
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