Compendium of Metabolomic and Genomic Datasets for Cyanobacteria: Mined the Gap

简编 蓝藻 代谢组学 天然产物 计算生物学 鉴定(生物学) 基因组学 有机体 生物 地理 生物信息学 遗传学 生态学 基因组 考古 生物化学 基因 细菌
作者
Scarlet Ferrinho,Helen Connaris,Nigel J. Mouncey,Rebecca J. M. Goss
出处
期刊:Water Research [Elsevier]
卷期号:256: 121492-121492
标识
DOI:10.1016/j.watres.2024.121492
摘要

Cyanobacterial blooms, producing toxic secondary metabolites, are becoming increasingly common phenomena in the face of rising global temperatures. They are the world's most abundant photosynthetic organisms, largely owing their success to a range of highly diverse and complex natural products possessing a broad spectrum of different bioactivities. Over 2600 compounds have been isolated from cyanobacteria thus far, and their characterisation has revealed unusual and useful chemistries and motifs including alkynes, halogens, and non-canonical amino acids. Genome sequencing of cyanobacteria lags behind natural product isolation, with only 19% of cyanobacterial natural products associated with a sequenced organism. Recent advances in meta(genomics) provide promise to narrow this gap and has also facilitated the uprise of combined genomic and metabolomic approaches, heralding a new era of discovery of novel compounds. Analyses of the datasets described within this manuscript reveal the asynchrony of current genomic and metabolomic data, highlight the chemical diversity of cyanobacterial natural products. Linked to this manuscript, we make these manually curated datasets freely accessible for the public to facilitate further research in this important area.
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