Genome-Wide Analysis of the GW2-Like Genes in Gossypium and Functional Characterization of the Seed Size Effect of GhGW2-2D

生物 拟南芥 巴巴多斯棉 基因 棉属 基因组 倍性 数量性状位点 苗木 发芽 植物 遗传学
作者
Li Huang,Shuxian Yang,Luyao Wu,Yue Xin,Jikun Song,Li Wang,Wenfeng Pei,Man Wu,Jiwen Yu,Xiaoyan Ma,Shoulin Hu
出处
期刊:Frontiers in Plant Science [Frontiers Media]
卷期号:13
标识
DOI:10.3389/fpls.2022.860922
摘要

Cotton is one of the most economically important crops worldwide. Seed size is a vital trait for plants connected with yield and germination. GW2 encodes a RING_Ubox E3 ubiquitin ligase that controls seed development by affecting cell growth. Here, are few reports on GW2 -like genes in cotton, and the function of GW2 in cotton is poorly understood. In the present study, a genome-wide analysis identified 6 and 3 GW2- like genes in each of the two cultivated tetraploids ( Gossypium hirsutum and G. barbadense ) and each of their diploid ancestral species ( G. arboreum , G. raimondii ), respectively. GhGW2-2D has the same functional domain and high sequence similarity with AtDA2 in Arabidopsis . Overexpression of GhGW2-2D in Arabidopsis significantly reduced seed and seedling size, suggesting GhGW2-2D is a potential target for regulating cotton seed size. These results provided information on the genetic and molecular basis of GW2 -like genes in cotton, thus establishing a foundation for functional studies of cotton seeds.

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