Bacterial tag encoded FLX titanium amplicon pyrosequencing (bTEFAP) based assessment of prokaryotic diversity in metagenome of Lonar soda lake, India

作者
Pravin Dudhagara,Anjana Ghelani,Rajesh Patel,Rajesh Chaudhari,Shreyas Bhatt
出处
期刊:Genomics data [Elsevier BV]
卷期号:4: 8-11 被引量:17
标识
DOI:10.1016/j.gdata.2015.01.010
摘要

Bacterial diversity and archaeal diversity in metagenome of the Lonar soda lake sediment were assessed by bacterial tag-encoded FLX amplicon pyrosequencing (bTEFAP). Metagenome comprised 5093 sequences with 2,531,282 bp and 53 ± 2% G + C content. Metagenome sequence data are available at NCBI under the Bioproject database with accession no. PRJNA218849. Metagenome sequence represented the presence of 83.1% bacterial and 10.5% archaeal origin. A total of 14 different bacteria demonstrating 57 species were recorded with dominating species like Coxiella burnetii (17%), Fibrobacter intestinalis (12%) and Candidatus Cloacamonas acidaminovorans (11%). Occurrence of two archaeal phyla representing 24 species, among them Methanosaeta harundinacea (35%), Methanoculleus chikugoensis (12%) and Methanolinea tarda (11%) were dominating species. Significant presence of 11% sequences as an unclassified indicated the possibilities for unknown novel prokaryotes from the metagenome.

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