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Single-cell atlas of human liver development reveals pathways directing hepatic cell fates

生物 器官发生 细胞生物学 诱导多能干细胞 细胞 电池类型 计算生物学 再生医学 肝星状细胞 肝细胞 干细胞 人肝 胚胎干细胞 生物信息学 遗传学 基因 内分泌学 体外
作者
Brandon T Wesley,Alex Ross,Daniele Muraro,Zhichao Miao,Sarah Saxton,Rute Tomaz,Carola Maria Morell,Katherine Ridley,Ekaterini D. Zacharis,Sandra Petrus‐Reurer,Judith Kraiczy,Krishnaa Mahbubani,Stephanie Brown,José Garcia‐Bernardo,Clara Alsinet,Daniel J. Gaffney,Olivia Tysoe,Rachel A. Botting,Emily Stephenson,Dorin-Mirel Popescu,Sonya A. MacParland,Gary D. Bader,Ian D. McGilvray,Daniel Ortmann,Fotios Sampaziotis,Kourosh Saeb‐Parsy,Muzlifah Haniffa,Kelly R. Stevens,Matthias Zilbauer,Sarah A. Teichmann,Ludovic Vallier
标识
DOI:10.1101/2022.03.08.482299
摘要

The liver has been studied extensively due to the broad number of diseases affecting its vital functions. However, therapeutic advances, especially in regenerative medicine, are currently hampered by the lack of knowledge concerning human hepatic cell development. Here, we addressed this limitation by describing the developmental trajectories of different cell types comprising the human fetal liver at single-cell resolution. These transcriptomic analyses revealed that sequential cell-to-cell interactions direct functional maturation of hepatocytes, with non-parenchymal cells playing critical, supportive roles during organogenesis. We utilised this information to derive bipotential hepatoblast organoids and then exploited this novel model system to validate the importance of key signalling pathways and developmental cues. Furthermore, these insights into hepatic maturation enabled the identification of stage-specific transcription factors to improve the functionality of hepatocyte-like cells generated from human pluripotent stem cells. Thus, our study establishes a new platform to investigate the basic mechanisms of human liver development and to produce cell types for clinical applications.
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