Translation of circular RNAs

生物 核糖核酸 翻译(生物学) 内部核糖体进入位点 核糖体 内含子 eIF4A标准 RNA编辑 环状RNA 信使核糖核酸 信号识别粒子RNA RNA结合蛋白 遗传学 外显子 计算生物学 细胞生物学 非编码RNA 基因
作者
Giorgi Margvelani,Karol Andrea Arizaca Maquera,Justin R. Welden,David W. Rodgers,Stefan Stamm
出处
期刊:Nucleic Acids Research [Oxford University Press]
被引量:8
标识
DOI:10.1093/nar/gkae1167
摘要

Circular RNAs (circRNAs) are covalently closed RNAs that are present in all eukaryotes tested. Recent RNA sequencing (RNA-seq) analyses indicate that although generally less abundant than messenger RNAs (mRNAs), over 1.8 million circRNA isoforms exist in humans, much more than the number of currently known mRNA isoforms. Most circRNAs are generated through backsplicing that depends on pre-mRNA structures, which are influenced by intronic elements, for example, primate-specific Alu elements, leading to species-specific circRNAs. CircRNAs are mostly cytosolic, stable and some were shown to influence cells by sequestering miRNAs and RNA-binding proteins. We review the increasing evidence that circRNAs are translated into proteins using several cap-independent translational mechanisms, that include internal ribosomal entry sites, N6-methyladenosine RNA modification, adenosine to inosine RNA editing and interaction with the eIF4A3 component of the exon junction complex. CircRNAs are translated under conditions that favor cap-independent translation, notably in cancer and generate proteins that are shorter than mRNA-encoded proteins, which can acquire new functions relevant in diseases.
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