PAM-Less CRISPR-SpRY Genome Editing in Plants

基因组 清脆的 基因组编辑 计算生物学 生物 DNA 遗传学 基因
作者
Simon Sretenovic,Xu Tang,Qiurong Ren,Yong Zhang,Yiping Qi
出处
期刊:Methods in molecular biology [Springer Science+Business Media]
卷期号:: 3-19 被引量:1
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-3131-7_1
摘要

Engineered SpCas9 variant, SpRY, has been demonstrated to facilitate protospacer adjacent motif (PAM) unrestricted targeting of genomic DNA in various biological systems. Here we describe fast, efficient, and robust preparation of SpRY-derived genome and base editors that can be easily adapted to target various DNA sequences in plants due to modular Gateway assembly. Presented are detailed protocols for preparing T-DNA vectors for genome and base editors and for assessing genome editing efficiency through transient expression of these reagents in rice protoplasts.
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