A SNP in the ABCC11 gene is the determinant of human earwax type

生物 等位基因 单倍型 遗传学 基因型 等位基因频率 SNP公司 多态性(计算机科学) 单核苷酸多态性 基因
作者
Koh-ichiro Yoshiura,Akira Kinoshita,Takafumi Ishida,Aya Ninokata,Toshihisa Ishikawa,Tadashi Kaname,Makoto Bannai,Katsushi Tokunaga,Shunro Sonoda,Ryoichi Komaki,Makoto Ihara,Vladimir Saenko,Gabit Alipov,Ichiro Sekine,Kazuki Komatsu,Haruo Takahashi,Mitsuko Nakashima,Nadiya Sosonkina,Christophe K. Mapendano,Mohsen Ghadami
出处
期刊:Nature Genetics [Nature Portfolio]
卷期号:38 (3): 324-330 被引量:284
标识
DOI:10.1038/ng1733
摘要

Human earwax consists of wet and dry types. Dry earwax is frequent in East Asians, whereas wet earwax is common in other populations. Here we show that a SNP, 538G --> A (rs17822931), in the ABCC11 gene is responsible for determination of earwax type. The AA genotype corresponds to dry earwax, and GA and GG to wet type. A 27-bp deletion in ABCC11 exon 29 was also found in a few individuals of Asian ancestry. A functional assay demonstrated that cells with allele A show a lower excretory activity for cGMP than those with allele G. The allele A frequency shows a north-south and east-west downward geographical gradient; worldwide, it is highest in Chinese and Koreans, and a common dry-type haplotype is retained among various ethnic populations. These suggest that the allele A arose in northeast Asia and thereafter spread through the world. The 538G --> A SNP is the first example of DNA polymorphism determining a visible genetic trait.
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