A bioinformatics approach to identify a disulfidptosis-related gene signature for prognostic implication in colon adenocarcinoma

基因 腺癌 签名(拓扑) 生物 生物信息学 计算生物学 癌症 遗传学 数学 几何学
作者
Gunchu Hu,Hongliang Yao,Zuxing Wei,Linye Li,Zhuowen Yu,Jian Li,Xiong Luo,Zhushu Guo
出处
期刊:Scientific Reports [Nature Portfolio]
卷期号:13 (1): 12403-12403 被引量:42
标识
DOI:10.1038/s41598-023-39563-y
摘要

Colon adenocarcinoma (COAD) is a type of cancer that arises from the glandular epithelial cells that produce mucus in the colon. COAD is influenced by various factors, including genetics, environment and lifestyle. The outcome of COAD is determined by the tumor stage, location, molecular characteristics and treatment. Disulfidptosis is a new mode of cell death that may affect cancer development. We discovered genes associated with disulfidptosis in colon adenocarcinoma and proposed them as novel biomarkers and therapeutic targets for COAD. We analyzed the mRNA expression data and clinical information of COAD patients from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database and Xena databases, extracted disulfidptosis-related genes from the latest reports on disulfidptosis. We used machine learning to select key features and build a signature and validated the risk model using data from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and Human Protein Atlas (HPA). We also explored the potential biological functions and therapeutic implications of the disulfidptosis-related genes using CIBERSORTx and GDSC2 databases. We identified four disulfidptosis-related genes: TRIP6, OXSM, MYH3 and MYH4. These genes predicted COAD patient survival and modulated the tumor microenvironment, drug sensitivity and immune microenvironment. Our study reveals the importance of disulfidptosis-related genes for COAD prognosis and therapy. Immune infiltration and drug susceptibility results provide important clues for finding new personalized treatment options for COAD. These findings may facilitate personalized cancer treatment.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
wang完成签到 ,获得积分10
1秒前
栗悟饭完成签到,获得积分10
2秒前
王子语完成签到,获得积分10
2秒前
7秒前
慕青应助喵喵采纳,获得10
7秒前
lz完成签到,获得积分10
7秒前
黑白好人完成签到,获得积分10
7秒前
Jiaying应助Son4904采纳,获得10
9秒前
10秒前
愉悦完成签到,获得积分10
11秒前
新洸完成签到 ,获得积分10
11秒前
微雨若,,完成签到 ,获得积分10
11秒前
Son4904完成签到,获得积分10
14秒前
木光完成签到,获得积分10
16秒前
16秒前
bener完成签到,获得积分10
18秒前
tianshanfeihe完成签到 ,获得积分10
21秒前
蓝莓完成签到 ,获得积分10
22秒前
安风完成签到 ,获得积分10
23秒前
尚影芷完成签到,获得积分10
24秒前
幸福耷完成签到 ,获得积分10
24秒前
小伟完成签到,获得积分10
25秒前
阿策完成签到,获得积分10
25秒前
花花2024完成签到 ,获得积分10
25秒前
Ly完成签到,获得积分10
25秒前
心如止水完成签到,获得积分10
27秒前
zhang568完成签到 ,获得积分10
27秒前
Doner完成签到,获得积分10
29秒前
30秒前
31秒前
朱哥永正完成签到,获得积分10
31秒前
日尧完成签到,获得积分10
32秒前
中华牌老阿姨完成签到,获得积分10
32秒前
32秒前
jixuchance完成签到,获得积分10
33秒前
十二完成签到,获得积分0
33秒前
自信南霜完成签到 ,获得积分10
34秒前
李健应助Son4904采纳,获得10
34秒前
邢邢完成签到,获得积分10
34秒前
英姑应助朝田诗浓浓采纳,获得10
35秒前
高分求助中
Principles of Economics, 11th Edition 10000
University Physics with Modern Physics, 16th edition 10000
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Arthritis and Related Conditions, An Issue of Orthopedic Clinics 1000
Development of a Bridge Weigh-In-Motion System: A technology to convert the bridge response to the passage of traffic into data on vehicle configurations, speeds, times of travel and weights 1000
ズームレンズの光学設計に関する研究 800
Fundamentals of Pharmaceutical and Biologics Regulations: A Global Perspective, Second Edition 700
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7290745
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8909860
关于积分的说明 18857277
捐赠科研通 6957998
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3209151
关于科研通互助平台的介绍 2378959
邀请新用户注册赠送积分活动 2184904