Transcriptome and metabolome integration analysis of mud crab Scylla paramamosain challenged to Vibrio parahaemolyticus infection

副热带青蟹 副溶血性弧菌 生物 转录组 代谢组 微生物学 背景(考古学) 代谢组学 生物化学 生物信息学 细菌 遗传学 基因 基因表达 古生物学
作者
Tongtong Kong,Shanmeng Lin,Xin Ren,Shengkang Li,Yi Gong
出处
期刊:Fish & Shellfish Immunology [Elsevier BV]
卷期号:103: 430-437 被引量:13
标识
DOI:10.1016/j.fsi.2020.05.069
摘要

Vibrio parahaemolyticus (V. parahaemolyticus) is a common pathogen for marine crustacean, which causes severe illnesses in aquatic animals. Therefore, it is meaningful to explore the mechanism during V. parahaemolyticus infection. In this study, to investigate the immune responses of mud crab Scylla paramamosain (S. paramamosain) to V. parahaemolyticus, we established the metabolic and transcriptional profiles of mud crab hemocytes challenged with V. parahaemolyticus. The results indicated that V. parahaemolyticus infection could induce a series of metabolism alterations at both metabolome and transcriptome levels, including biosynthesis of amino acids and Aminoacyl-tRNA, Purine and pyrimidine metabolism, TCA cycle and glutamine metabolism. In this context, through the integration of metabolomics and transcriptomics, our study provided a more comprehensive understanding of the biological process in mud crab against pathogen infection.
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