Установлено, что олигогексаметиленгуанидин очень медленно реагирует с неактивированными алкилгалогенидами с высокой молекулярной массой (додецилхлорид), что, возможно, обусловлено стерическими затруднениями и низкой нуклеофильностью гуанидинового фрагмента, поэтому данный алкилгалогенид не может быть использован для модификации олигомера в обычных условиях. Этилированные производные олигомера получаются гораздо легче, однако они имеют сильный разброс степени замещения (при одинаковых условиях и соотношении реагентов). Одновременно показано, что при алкилировании антибактериальная активность производных понижается по сравнению с гидрохлоридом исходного олигомера. Бензилхлорид легко реагирует с олигомером и при этом получаются производные с желаемой степенью замещения. Установлено, что бензильные производные со степенью замещения 0,2 обладают повышенной активностью в отношении микобактерий по сравнению с исходным гидрохлоридом, при дальнейшем увеличении степени замещения активность постепенно снижается. Возможно, повышение активности связано с оптимальным увеличением гидрофобности и/или пространственной структуры олигомера. Наличие достаточно высокой антибактериальной активности бензильных производных в отношении Mycobacterium smegmatis штамм АТСС 607 делает перспективными дальнейшие работы по получению и изучению свойств алкилированых производных олигогесаметиленгуанидина с целью получения еще более активных производных, в т.ч. против M. smegmatis. Наиболее очевидными кандидатами могут стать метилкарбоксизамещенные производные олигомеров.