Temperature effect on CRISPR-Cas9 mediated genome editing

清脆的 基因组编辑 转录激活物样效应核酸酶 锌指核酸酶 Cas9 生物 核酸酶 遗传学 效应器 计算生物学 基因 细胞生物学
作者
Guanghai Xiang,Xingying Zhang,Chenrui An,Chen Cheng,Haoyi Wang
出处
期刊:Journal of Genetics and Genomics [Elsevier BV]
卷期号:44 (4): 199-205 被引量:78
标识
DOI:10.1016/j.jgg.2017.03.004
摘要

Zinc-finger nuclease (ZFN), transcription activator-like effector nuclease (TALEN), and clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9 (CRISPR-Cas9) are the most commonly used genome editing tools. Previous studies demonstrated that hypothermia treatment increased the mutation rates induced by ZFNs and TALENs in mammalian cells. Here, we characterize the effect of different culture temperatures on CRISPR-Cas9 mediated genome editing and find that the genome editing efficiency of CRISPR-Cas9 is significantly hampered by hypothermia treatment, unlike ZFN and TALEN. In addition, hyperthermia culture condition enhances genome editing by CRISPR-Cas9 in some cell lines, due to the higher enzyme activity and sgRNA expression level at higher temperature. Our study has implications on CRISPR-Cas9 applications in a broad spectrum of species, many of which do not live at 37°C.
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