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辣椒 HD-Zip 转录因子家族鉴定与生物信息学分析

邮政编码 地理 地图学
作者
陈国良,Sup 陈国梁,高瑜,Sup 高瑜,张昊,Sup 张昊,王亚洁,Sup 王亚洁,王睿,Sup 王睿,王延峰,Sup 王延峰
出处
期刊:《分子植物育种》印刷版 卷期号:18 (10)
摘要

从辣椒基因组数据库中鉴定 HD-Zip 转录因子,并对其进行生物信息学分析。对鉴定到的转录因子的基本理化性质、染色体定位、系统进化、保守基序和基因结构进行分析。共鉴定到 45 个辣椒 HD-Zip 转录因子;该家族成员均含有高度保守的 HD-Zip 结构域; 45 个 HD-Zip  基因以不均匀的方式分布在 12 条染色体上。根据拟南芥 HD-Zip 家族分类关系,在结合辣椒 HD-Zip  基因结构的特点分为 Group I 、 Group II 、 Group III 和 Group IV 。辣椒 HD-Zip  转录因子在同一亚族中含有相同的保守基序和基因结构。本研究初步明确了辣椒  HD-Zip  转录因子家族成员进化关系和结构特点,为进一步研究辣椒 HD-Zip  转录因子家族的系统发育以及生物学功能提供了依据,为辣椒的分子育种提供科学依据。

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