亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

A high-quality genome of Actinidia eriantha provides new insight into ascorbic acid regulation

抗坏血酸 生物 转录组 WRKY蛋白质结构域 基因组 基因 猕猴桃 顺序装配 计算生物学 遗传学 植物 园艺 基因表达
作者
Guanglian Liao,Chunhui Huang,Dongfeng Jia,Min Zhong,Junjie Tao,Xueyan Qu,Xiaobiao Xu
出处
期刊:Journal of Integrative Agriculture [Elsevier BV]
卷期号:22 (11): 3244-3255 被引量:10
标识
DOI:10.1016/j.jia.2023.07.018
摘要

Actinidia eriantha is one of the species with particularly high ascorbic acid (AsA) content in kiwifruit. However, the molecular mechanism of AsA rich in fruit remain unclear. In order to reveal the molecular mechanism of AsA rich in A. eriantha, this study constructed a regulatory network related to AsA metabolism by combining genomics, metabolomics and transcriptomics. Here, we assembled a high-quality genome of A. eriantha 'Ganlv 1' with only five gaps remained. The assembly is comprising of 29 pseudochromosomes with a total size of 615.95 Mb, and contig N50 of 20.35 Mb. Among them, 24 pseudochromosomes were directly from telomere-to-telomere. The LTR assembly index score and consensus quality value were 21.34% and 39.90%, respective. Subsequently, 61 metabolites and 2,092 genes were found to be differentially accumulated/expressed during fruit development by metabolome and transcriptome assay, respectively. For the AsA metabolism, and the cyclic regeneration pathway were observed to the high expression levels throughout the fruit growth and development, suggesting its crucial role in the regulation of AsA. Furthermore, AsA contents are highly associated with ascorbate peroxidase genes. Our genome provides genomic resources for the genetic and breeding research of A. eriantha, and the constructed regulatory network would provide the public data platform for future research on kiwifruit.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
efren1806完成签到,获得积分10
8秒前
魔术师完成签到,获得积分10
16秒前
24秒前
Victor3发布了新的文献求助30
25秒前
369ninja应助科研通管家采纳,获得10
25秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得20
25秒前
Kao应助Benjamin采纳,获得10
28秒前
负责的如萱完成签到,获得积分10
33秒前
47秒前
Kikiya发布了新的文献求助10
53秒前
美丽的迎蕾完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
隐形曼青应助Kikiya采纳,获得10
1分钟前
1分钟前
可爱的柜子完成签到,获得积分10
1分钟前
深情的朝雪完成签到,获得积分10
2分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
gao0505完成签到,获得积分10
2分钟前
kkk发布了新的文献求助10
2分钟前
kkk完成签到,获得积分20
2分钟前
cc关注了科研通微信公众号
3分钟前
fabius0351完成签到,获得积分10
3分钟前
奋斗的枫叶完成签到,获得积分10
3分钟前
Victor3完成签到,获得积分20
3分钟前
互助完成签到,获得积分0
3分钟前
苗条的傲安完成签到,获得积分10
4分钟前
cc完成签到,获得积分10
4分钟前
所所应助Zer0采纳,获得10
4分钟前
伶俐的一斩完成签到,获得积分10
5分钟前
Zer0完成签到,获得积分10
5分钟前
5分钟前
Zer0发布了新的文献求助10
5分钟前
真实的荣轩完成签到,获得积分10
5分钟前
jxjsyf完成签到 ,获得积分10
5分钟前
落后安青完成签到,获得积分10
6分钟前
小西贝完成签到 ,获得积分10
6分钟前
6分钟前
大菠萝5发布了新的文献求助10
6分钟前
6分钟前
Lin完成签到 ,获得积分10
6分钟前
高分求助中
Principles of Economics, 11th Edition 10000
University Physics with Modern Physics, 16th edition 10000
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition 510
Social Skills Improvement System-Rating Scales--Chinese Version 500
Dynamische Polarisation von H-1 und B-11 in (CH-3)-3NBH-3 500
CLSI M07 2024 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7247723
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8870706
关于积分的说明 18712132
捐赠科研通 6926074
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3197998
关于科研通互助平台的介绍 2373776
邀请新用户注册赠送积分活动 2172888