Integrated bioinformatic analysis of key biomarkers and signalling pathways in psoriasis

银屑病 医学 小桶 ISG15 计算生物学 基因 SOCS3 生物信息学 免疫学 转录组 基因表达 遗传学 生物 抑制器 泛素
作者
Suwei Tang,Weiping Jiang,Ping Xu,Sai‐Sai Xie,Mingxia Wang,Chunjie Gao,Jiajing Lu,Yang Yang
出处
期刊:Scottish Medical Journal [SAGE]
卷期号:67 (1): 7-17 被引量:2
标识
DOI:10.1177/00369330221078993
摘要

Psoriasis is a relatively common autoimmune inflammatory skin disease with a chronic etiology. Since psoriasis is still incurable, it is necessary to identify the molecular mechanisms of psoriasis. The present study was designed to detect novel biomarkers and pathways associated with psoriasis incidence, and provide new insights into treatment of psoriasis.Differentially expressed genes (DEGs) associated with psoriasis in the Gene Expression Omnibus (GEO) database were identified, and their functional roles and interactions were then annotated and evaluated through GO, KEGG, and gene set variation (GSVA) analyses. In total 197 psoriasis-related DEGs were identified and found to primarily be associated with the NOD-like receptor, IL-17, and cytokine-cytokine receptor interaction signalling pathways. GSVA revealed significant differences between normal and lesional groups (P < 0.05), while PPI network analyses identified CXCL10 as the hub gene with the highest degree value, whereas IRF7, IFIT3, OAS1, GBP1, and ISG15 were promising candidate genes for the therapeutic treatment of psoriasis.The findings of the present integrated bioinformatics may enhance our understanding of the molecular events occurring in psoriasis, and these candidate genes and pathways together may prove to be therapeutic targets for psoriasis.
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