Comparative Analysis of Machine Learning Approaches for Antimicrobial Peptide Prediction

抗菌剂 支持向量机 抗真菌 抗菌肽 计算生物学 计算机科学 人工智能 机器学习 生物 微生物学
作者
Thirumurthy Madhavan,Anchita Das Sharma,S. Chowdhury,Ben Othman Soufiene
出处
期刊:Advances in medical technologies and clinical practice book series 卷期号:: 187-213
标识
DOI:10.4018/979-8-3693-2238-3.ch008
摘要

Antimicrobial resistance (AMR) is a global issue due to improper drug use in humans and animals. Antimicrobial peptides (AMPs) show promise in targeting bacteria with minimal harm to host cells and low risk of resistance development. Machine learning enhances accuracy in predicting AMPs. Common classifiers include SVM, RF, ANN, LGBM, and DT. This review compares peptide prediction tools based on machine learning, assessing performance using cross-validation. Carefully chosen independent datasets were used to evaluate predictive efficiency. By utilizing a variety of ML methods, the best techniques for predicting Antimicrobial peptides, Antibacterial peptides, Antifungal peptides can be developed quickly

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