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Curtanaerobium respiraculi gen. nov., sp. nov., a novel anaerobic bacterium isolated from human bronchoalveolar lavage fluid

生物 16S核糖体RNA 微生物学 系统发育树 糖脂 基因组DNA 核糖体RNA 磷脂酰甘油 细菌 化学分类学 拉伤 基因 分类学(生物学) 植物 遗传学 生物化学 磷脂 解剖 磷脂酰胆碱
作者
Yifan Sun,Likun Wang,Dexing Han,Jianjie Li,Yuejiao Liu,Yafang Tan,Zhiyuan Pan,Ruifu Yang,Pinghua Qu,Ziping Wang,Yujing Bi
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:73 (5) 被引量:2
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005864
摘要

Two related anaerobic strains, designated as SWB101512T and SWB19611, were isolated from the bronchoalveolar lavage fluid of two lung cancer patients. Cells were Gram-stain-positive, non-motile and non-spore-forming. Growth could be observed at 26-45 °C (optimum, 37 °C), pH 5.0-8.5 (optimum, pH 7.0) and with 0.5-2.0 % (v/w) NaCl (optimum, 1.0%). The 16S rRNA gene sequences of SWB101512T and SWB19611 showed the highest similarities to Denitrobacterium detoxificans DSM 21843T (91.1 and 91.3 %, respectively). The phylogenetic tree based on the 16S rRNA gene sequences and the core genome sequences demonstrated that the two strains clustered together and formed a distinct lineage within the family Eggerthellaceae. The DNA G+C contents of strains SWB101512T and SWB19611 were 62.0 and 61.9 mol%, respectively. The predominant cellular fatty acids of strains SWB101512T and SWB19611 were C16 : 0 DMA (27.8 and 28.8 %, respectively). The respiratory menaquinone in both strains was menaquinone 6 and the polar lipid profile consisted of diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, two phospholipids, three glycolipids and three unidentified lipids. Based on evidence from phenotypic, chemotaxonomic and genomic analyses, a new genus and species belonging to the family Eggerthellaceae, named Curtanaerobium respiraculi gen. nov., sp. nov. is proposed. The type strain is SWB101512T (=GDMCC 1.2991T=JCM 35330T).
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