Crystal structure and substrate specificity of the thermophilic serine:pyruvate aminotransferase fromSulfolobus solfataricus

硫矿硫化叶菌 活动站点 辅因子 化学 裂解酶 生物化学 热稳定性 吡哆醛 立体化学 磷酸吡哆醛 古细菌 基因
作者
C. Sayer,Martin Bommer,Michail N. Isupov,John M. Ward,Jennifer A. Littlechild
出处
期刊:Acta Crystallographica Section D-biological Crystallography [Wiley]
卷期号:68 (7): 763-772 被引量:32
标识
DOI:10.1107/s0907444912011274
摘要

The three-dimensional structure of the Sulfolobus solfataricus serine:pyruvate aminotransferase has been determined to 1.8 Å resolution. The structure of the protein is a homodimer that adopts the type I fold of pyridoxal 5'-phosphate (PLP)-dependent aminotransferases. The structure revealed the PLP cofactor covalently bound in the active site to the active-site lysine in the internal aldimine form. The structure of the S. solfataricus enzyme was also determined with an amino form of the cofactor pyridoxamine 5'-phosphate bound in the active site and in complex with gabaculine, an aminotransferase inhibitor. These structures showed the changes in the enzyme active site during the course of the catalytic reaction. A comparison of the structure of the S. solfataricus enzyme with that of the closely related alanine:glyoxylate aminotransferase has identified structural features that are proposed to be responsible for the differences in substrate specificity between the two enzymes. These results have been complemented by biochemical studies of the substrate specificity and thermostability of the S. solfataricus enzyme.

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