Characterization of methanotrophic bacteria isolated from a subtropical paddy field

16S核糖体RNA 细菌 拉伤 微生物学 核糖体RNA 根际 化学 甲烷 氮气 产甲烷菌 生物 生物化学 基因 有机化学 遗传学 解剖
作者
Dayèri Dianou
出处
期刊:Fems Microbiology Letters [Oxford University Press]
卷期号:173 (1): 163-173 被引量:2
标识
DOI:10.1016/s0378-1097(99)00066-x
摘要

Isolation and characterization of methane-oxidizing bacteria from a subtropical paddy field of Ishigaki, Japan, were performed. Two strains, namely R16 and R18, of Methylosinus-like organisms were isolated from methane enrichment cultures of rice rhizosphere. The isolates were motile, and stained Gram-negative. Cells of strains R16 and R18 were short rods, while slightly curved cells and coccobacillus-like cells were also observed for strains R16 and R18, respectively. Strain R16 was slightly smaller in size than R18. The organisms had an optimal pH range of 6.3–6.8 and a temperature optimum of 29–30°C. Methane and methanol were used as sole carbon and energy sources. Nitrate and ammonium sulfate could serve as nitrogen sources. The acetylene reduction method showed that the strains were able to fix nitrogen. On the basis of morphological and physiological properties, and 16S rRNA gene sequence analysis, the organisms were identified as genus Methylosinus. Strain R16 shows the highest 16S rRNA gene similarity of 95.5% with Methylosinus trichosporium, whereas R18 shows the highest 16S rRNA gene similarity with Methylosinus sporium (95.6%).
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