Trigging Isothermal Circular Amplification-Based Tuning of Rigorous Fluorescence Quenching into Complete Restoration on a Multivalent Aptamer Probe Enables Ultrasensitive Detection of Salmonella

适体 沙门氏菌 化学 环介导等温扩增 荧光 信号(编程语言) 生物系统 猝灭(荧光) 等温过程 检出限 生物物理学 色谱法 纳米技术 细菌 分子生物学 计算机科学 生物化学 光学 物理 材料科学 生物 DNA 遗传学 程序设计语言 热力学
作者
Jianguo Xu,Xinlei Zhang,Chao Yan,Panzhu Qin,Yao Li,Qi Wang,Wei Chen
出处
期刊:Analytical Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:94 (2): 1357-1364 被引量:30
标识
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04638
摘要

Detection of pathogenic bacteria is of vital significance for combating and preventing infectious diseases. In this work, we developed a multivalent aptamer probe (Multi-VAP)-based trigging isothermal circular amplification (TICA) for rapidly and ultrasensitively detecting Salmonella. In this sensing system, the fluorescence of Multi-VAP was strongly quenched via the dual effect of FRET. Introduction of Salmonella to the system forced the configuration change of Multi-VAP, leading to the occurrence of a TICA responsible for tuning all of the fluorescence-quenched Multi-VAP into a complete restoration state. This prominent feature allows the reasonable combination of a strong background restraint and great target signal amplification into one sensing system, which in turn benefits the improvement of the signal-to-noise ratio to ensure that the system has an ultrahigh sensitivity. Combined with the employment of an aptamer to ensure that it has excellent specificity, the Salmonella can be quantitatively and qualitatively analyzed even from human serum. The total processing merely requires sample addition and incubation. The turnaround time of the complete analysis from "sample-to-result" was within 30 min. With the method to decrease the time to detect and simplify the process to operate, the assay was successfully used as a sensing platform for specific detection of as few as 9 CFU/mL Salmonella.
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