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[Genetic analysis of a pedigree affected with congenital high myopia caused by a novel splice site variant of COL11A1 gene].

先证者 遗传学 桑格测序 外显子组测序 剪接 生物 基因 复合杂合度 遗传分析 剪接位点突变 DNA测序 突变 外显子 选择性拼接
作者
Xiurong Yu,Yichu Liu,Fenghua Lan,Qingqin S. Li,Ying Zhong Tang,Zhihong Wang
出处
期刊:PubMed [National Institutes of Health]
卷期号:36 (9): 893-896
标识
DOI:10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2019.09.010
摘要

To analyze genetic variant in a pedigree affected with congenital high myopia.Whole exome sequencing (WES) was carried out for the proband. Suspected variation was verified with Sanger sequencing. The pedigree was also subjected to co-segregation analysis.WES has identified a novel splice site heterozygous variant (c.2556+1G>A) in the COL11A1 gene in the proband. Co-segregation analysis of the pedigree showed that the affected mother and two daughters of the proband have carried the same variant(c.2556+1G>A), while his unaffected father and sister did not. Based on the ACMG Standards and Guidelines for the Interpretation of Sequence Variants, the variant was classified as "likely pathogenic" (PVS1+PM2).A novel splice variant (c.2556+1G>A) of the COL11A1 gene has been identified in a pedigree affected with congenital high myopia, which probably underlies the disease.
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