Trans-ancestry genome-wide association study identifies 12 genetic loci influencing blood pressure and implicates a role for DNA methylation

生物 DNA甲基化 遗传学 全基因组关联研究 遗传关联 遗传谱系 DNA 甲基化 基因组 计算生物学 单核苷酸多态性 人口 基因 基因型 基因表达 社会学 人口学
作者
Norihiro Kato,Marie Loh,Fumihiko Takeuchi,Niek Verweij,Xu Wang,Weihua Zhang,Tanika N Kelly,Danish Saleheen,Benjamin Lehne,Irene Mateo Leach,Alexander Drong,James Abbott,Simone Wahl,Sian-Tsung Tan,William R. Scott,Gianluca Campanella,Marc Chadeau‐Hyam,Uzma Afzal,Tarunveer S. Ahluwalia,Marc Jan Bonder
出处
期刊:Nature Genetics [Springer Nature]
卷期号:47 (11): 1282-1293 被引量:363
标识
DOI:10.1038/ng.3405
摘要

We carried out a trans-ancestry genome-wide association and replication study of blood pressure phenotypes among up to 320,251 individuals of East Asian, European and South Asian ancestry. We find genetic variants at 12 new loci to be associated with blood pressure (P = 3.9 × 10(-11) to 5.0 × 10(-21)). The sentinel blood pressure SNPs are enriched for association with DNA methylation at multiple nearby CpG sites, suggesting that, at some of the loci identified, DNA methylation may lie on the regulatory pathway linking sequence variation to blood pressure. The sentinel SNPs at the 12 new loci point to genes involved in vascular smooth muscle (IGFBP3, KCNK3, PDE3A and PRDM6) and renal (ARHGAP24, OSR1, SLC22A7 and TBX2) function. The new and known genetic variants predict increased left ventricular mass, circulating levels of NT-proBNP, and cardiovascular and all-cause mortality (P = 0.04 to 8.6 × 10(-6)). Our results provide new evidence for the role of DNA methylation in blood pressure regulation.
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